都立明堂学園は創立百五十年の歴史ある名門高校だが、現在は生徒達を牛耳る番長連合が学園を支配する暴力の巣窟となっていた。そんな状況のなか平和な学園を取り戻そうと、一握りの教師と生徒会長である伊藤アヤカは学園の清浄化のため日夜闘い続けていた！しかし、日増しに勢力を拡大して行く番長連合の脅威に、学園長はついにある決断をくだす。それはスケバンファイターの異名を取る伝説の女番長（ミサキ）を用心棒として雇い、悪の根源である番長連合を一掃するというものだった！